EM菌とは、Effective Microorganismsの略で訳すと「有用な微生物群」となる。
地球上には何億種類もの微生物が生息しているが、EM菌はその中で農業や環境に有用な10属80種の微生物を培養したものである。EM菌は、主に乳酸菌群、酵母群、光合成細菌群で構成され、これらの微生物が共存しているものである。
EM菌の特性を以下に記す。
１、エサ（栄養）として、①糖蜜、②米ヌカを大いに好み、③有機物、④糞尿や汚泥もエサとします。
２、酸素については、好む菌（好気性菌）、どちらでもよい菌（通性嫌気性菌）及び酸素があっては育たない菌（絶対嫌気性菌） を含んでいます。
３、温度は、25～40°で活発に生育します。
４、微生物が育つには水分が必要です。EM菌も適度の水分を好みます。
５、EM菌が働きやすい土壌のPHは、微アルカリ性（PH5.5～PH6.5）です。
EM菌は環境の分野でも活用されていますが、農業の分野でも多いに活用されています。
EM菌の利用方法
EM菌は、10属80種類もの微生物から成り立っているので自分では培養はできない。EM菌を眠らせた原液すなわちEM１を購入し用途に合わせた形態で利用する。
原料・形態及び製法
１、原料の説明 EM1・・・・EM菌の原液
糖蜜・・・・・・さとうきびから作った蜜
EMセラミックスパウダー・・・・・EMを粘土に混入させ、焼いたセラミックスを微粉末にしたパウダー
２、EM希釈液 EM1の原液を水でうすめたもの
100倍希釈 原液、１ ： 水、100
1000倍希釈 100倍希釈液、１ ： 水、10
３、EM活性液 原液に糖蜜を加え水でうすめ温かい場所で1週間程度おいてつくる（EMセラミックスパウダーを入れるとなお 良い）
100倍活性液 原液１＋糖蜜１＋EMセラミックスパウダー極く少量＋水100
1000倍活性液 100倍活性液１＋水１０
４、EM発酵液 EM生ごみ発酵肥料をつくる過程で出てくる液
５、EMぼかしⅠ型 EM100倍活性液＋米ぬか＋EMセラミックスパウダー （モミガラを入れる方法もあります）
約10リットル分
米ぬか４kgとEMセラミックスパウダー少々（5g位）を混ぜ合わせ、EM100倍活性液
を少しずつ加え、液が米ぬかにしっかりと沁みこむようにする。手で握るとパラパラ落ちなくて塊になるくらいまで加える 。その後、ビニール袋や空気の入らない容器に入れ密封し、直射日光があたらない場所で保管する。保管期間は、夏場で30日程度、春・秋で45日程度、冬場で60日程度である。
米ぬかとEM100倍活性液の比率は、米ぬかの水分やその日の湿度で違ってくる。ポイントは、手で握ってみて塊になる程度まで活性液を加え良く混ぜる。
６、EMぼかしⅡ型 EM100倍活性液＋米ぬか＋油粕＋魚粉＋EMセラミックスパウダー
約15リットル分
米ぬか４kg、油粕1.5kg、魚粉1.5kg、EMセラミックスパウダー少々（5g位）を混ぜ合わせ、EM100倍活性液
を少しずつ加え、液が米ぬかにしっかりと沁みこむようにする。手で握るとパラパラ落ちなくて塊になるくらいまで液を加える 。その後、ビニール袋や空気の入らない容器に入れ密封し、直射日光があたらない場所で保管する。保管期間は夏場で30日程度、春・秋で45日程度、冬場で60日程度である。
米ぬか・油粕・魚粉とEM100倍活性液の比率は、米ぬか・油粕・魚粉の水分やその日の湿度で違ってくる。ポイントは、手で握ってみて塊になる程度まで活性液を加え良く混ぜる。
７、生ごみ発酵肥料
生ごみを密閉容器（EM用として市販されている）に入れ、EMぼかしⅠ型と混ぜたもの。
作り方
１、密閉容器の底に新聞紙を敷く
２、毎日出てくる生ごみ（水分を切っておく）を入れEMぼかしⅠ型と良く混ぜる
３、上から圧縮し蓋をしっかり締め空気に触れないようにしておく
４、容器の下のコックを開け発酵液を抜く（発酵液は排水孔の清掃に使える）
５、2～4までを繰り返し容器がいっぱいになったらフタをしっかり締めて1週間（冬場は2週間）程度発酵させる
出来上がると漬物のような匂いがする